Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1SQ13698 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1SQ13698 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
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