Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CUL4AQ13619 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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