Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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