Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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