Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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