Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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