Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DANCR-202ENST00000425653 823 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.932e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 SEH1L-208ENST00000590843 5206 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 RPS6KB2-207ENST00000525996 957 ntTSL 520.97■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 20
PABPC4Q13310 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.593e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)25.46■■□□□ 1.672e-17■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.994e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.564e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.374e-7■■■■□ 20
PABPC4Q13310 TMEM132D-AS1-201ENST00000508925 627 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.042e-14■■■■□ 20
PABPC4Q13310 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.973e-8■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.654e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.514e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.464e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 215.86■□□□□ 0.134e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 DNM2-221ENST00000593203 2507 ntTSL 215.83■□□□□ 0.124e-9■■■■□ 20
PABPC4Q13310 WDR18-210ENST00000591997 577 ntTSL 324.67■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 522.15■■□□□ 1.142e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 520.22■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 519.45■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.212e-20■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-208ENST00000459870 1317 ntTSL 516.71■□□□□ 0.271e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-216ENST00000482248 887 ntTSL 514.99□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-211ENST00000470113 954 ntTSL 514.69□□□□□ -0.061e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-225ENST00000634336 486 ntTSL 513.52□□□□□ -0.251e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-224ENST00000497635 386 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-229ENST00000634473 643 ntTSL 511.94□□□□□ -0.51e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-207ENST00000453392 859 ntTSL 511.5□□□□□ -0.571e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-223ENST00000494984 679 ntTSL 211.2□□□□□ -0.621e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-220ENST00000487495 451 ntTSL 38.65□□□□□ -1.021e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QARS-210ENST00000466179 334 ntTSL 35.63□□□□□ -1.511e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-7■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.592e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.542e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QDPR-205ENST00000507439 1374 ntTSL 230.14■■■□□ 2.412e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.382e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.322e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.252e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.222e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.672e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.652e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.472e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 TSSC4-206ENST00000440813 851 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.98■■□□□ 1.432e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.352e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.312e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 COL18A1-207ENST00000473212 2515 ntTSL 223.15■■□□□ 1.32e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 C16orf59-213ENST00000569994 2156 ntTSL 222.79■■□□□ 1.242e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.236e-7■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 CCDC43-204ENST00000588687 721 ntTSL 222.64■■□□□ 1.212e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 EFHD2-202ENST00000445566 899 ntTSL 522.62■■□□□ 1.212e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.142e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.142e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MAP2K2-204ENST00000595715 861 ntTSL 521.64■■□□□ 1.056e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.972e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ILKAP-202ENST00000450411 1024 ntTSL 220.9■□□□□ 0.942e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 RDH13-221ENST00000592573 1481 ntTSL 220.73■□□□□ 0.911e-15■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.862e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 C16orf59-206ENST00000565716 1457 ntTSL 1 (best)20.35■□□□□ 0.852e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 220.17■□□□□ 0.822e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.782e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 RGL2-240ENST00000471319 1037 ntTSL 519.47■□□□□ 0.712e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 SART1-205ENST00000529580 390 ntTSL 219.44■□□□□ 0.79e-9■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 CENPBD1P1-202ENST00000473164 944 ntTSL 219.44■□□□□ 0.72e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.67■□□□□ 0.422e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 DEXI-203ENST00000570992 626 ntTSL 317.47■□□□□ 0.392e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.372e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 DGKQ-203ENST00000509465 4362 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.96■□□□□ 0.152e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ILKAP-205ENST00000465131 750 ntTSL 215.67■□□□□ 0.12e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ABHD16A-206ENST00000474007 506 ntTSL 514.88□□□□□ -0.032e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 214.57□□□□□ -0.082e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.221e-15■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ABHD16A-205ENST00000471644 746 ntTSL 313.35□□□□□ -0.272e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ABHD16A-211ENST00000490209 615 ntTSL 213.35□□□□□ -0.272e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 ILKAP-206ENST00000466468 2651 ntTSL 212.9□□□□□ -0.342e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 S100A1-201ENST00000292169 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-15■■■■□ 19.9
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