Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RIGQ13278 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RIGQ13278 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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RIGQ13278 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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