Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ECH1Q13011 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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