Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC15Q0P6D6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms