Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SSRP1Q08945 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSRP1Q08945 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms