Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CD300CQ08708 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms