Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP4F3Q08477 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms