Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF4Q08170 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms