Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC9Q06265 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC9Q06265 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms