Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTDSPL2Q05D32 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms