Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms