Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms