Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TAP2Q03519 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TAP2Q03519 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms