Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CENPCQ03188 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms