Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOP2BQ02880 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOP2BQ02880 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms