Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms