Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLOD1Q02809 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms