Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF17Q02223 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms