Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD1P98174 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD1P98174 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms