Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL20P78556 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL20P78556 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL20P78556 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL20P78556 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL20P78556 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL20P78556 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL20P78556 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms