Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL13RA1P78552 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL13RA1P78552 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms