Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELF3P78545 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELF3P78545 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ELF3P78545 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ELF3P78545 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ELF3P78545 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ELF3P78545 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms