Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RPS28P62857 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms