Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2NP61088 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms