Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNAP25P60880 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms