Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms