Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFC1P60507 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVFC1P60507 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms