Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY3P57055 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms