Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRG3P56975 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRG3P56975 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG3P56975 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms