Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC4P56524 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC4P56524 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms