Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BGRP55822 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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