Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUP98P52948 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUP98P52948 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP98P52948 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms