Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMSP52788 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMSP52788 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMSP52788 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMSP52788 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMSP52788 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMSP52788 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMSP52788 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMSP52788 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMSP52788 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms