Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP5P51878 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP5P51878 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP5P51878 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP5P51878 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CASP5P51878 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CASP5P51878 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP5P51878 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms