Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLCN5P51795 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCN5P51795 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms