Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms