Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTDSS1P48651 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms