Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME1P48163 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME1P48163 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME1P48163 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME1P48163 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME1P48163 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms