Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IQGAP1P46940 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IQGAP1P46940 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms