Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACADSBP45954 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms