Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRATP43155 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CRATP43155 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRATP43155 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRATP43155 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRATP43155 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms