Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGCXP38435 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GGCXP38435 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GGCXP38435 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GGCXP38435 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GGCXP38435 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GGCXP38435 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGCXP38435 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGCXP38435 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GGCXP38435 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms