Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TGFBR1P36897 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGFBR1P36897 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms