Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms